コースについては、７区間・全長４３．４ｋｍ。トップアスリートが集う大会では、これまでに例のない厳しいコースとなっています。
コースの高低差は１６７ｍ（最高標高１７２ｍ・最低標高５ｍ）
スタートの富士山本宮浅間大社は標高１２０ｍ、１区（６．６ｋｍ）では標高４２ｍの第１中継所まで長い下りが続きます。２区（３．５ｋｍ）３区（４．４ｋｍ）は、短い距離のつなぎのスピード区間ですが、緩やかな下りに加え、東海道線の高架橋などアップダウンがあり選手を悩ませます。４区は最長区間（９．４ｋｍ）海岸線（しらす街道）・古くからの富士山の景勝地・田子の浦港などを走るほぼ平坦なコースです。５区（５．０ｋｍ）６区（６．８ｋｍ）では、長い直線コースが続きます。そして最大のポイントとなるのが最終７区（７．７ｋｍ）です。たすきを受けた２ｋｍ過ぎから、厳しい上りが続きます。その高低差は約４．６ｋｍで１６３ｍ。その中で源太坂（７区３．８ｋｍ地点）には急激な下りもあり、これも選手を悩ませます。フィニッシュの富士総合運動公園陸上競技場手前が最高標高の１７２ｍ。女子の全国規模の駅伝では、これまでにないタフなコースとなっています。
もうひとつのコースの特長は、様々な場面で、雄大な富士山の姿をみることが出来ます。スタートとなる富士山本宮浅間大社、富士川河川敷道路、田子の浦港、第５中継所地点、そして、勝負のポイントとなる７区厳しい上りの大渕街道では、正面から富士山が選手の奮闘を見守ります。フィニッシュとなる富士総合運動公園陸上競技場は、世界遺産登録なった雄大な富士山が選手のゴールを後押しします。
昨年は残念ながら富士山をわずかにしか見ることができませんでしたが、１２月２３日の過去２３年の富士山が見られる確率は、９０％。（富士市役所資料・午前８時計測）富士山に抱かれながら走る大学女子のトップアスリート達の戦いです。